En Otavalo existen un sinnúmero de instituciones tanto públicas como privadas que contribuyen al desarrollo y progreso de Otavalo. Entre las diversas instituciones también podemos encontrar aquellas que desarrollan sus actividades sin fines de lucro, organismos de investigación científica, cultural y deportiva. Hemos tratado de recopilar aquellas instituciones más sobresalientes y de trascendencia otavaleña:

 INTITUTO OTAVALEÑO DE ANTROPOLOGIA, ante todo un Centro de Cultura, con caracteres específicos en el área de la antropología, y con la difusión de programas de extensión cultural.
Ver más 

 CENTRO DE ESTUDIOS PLURICULTURALES, es una institución privada sin fines de lucro, integrada por profesionales  Kichwas, con sede en la ciudad de Otavalo, Provincia de Imbabura, Ecuador.
Ver más 

 JAMBI HUASI: es una institución privada sin fines de lucro, que está integrada por profesionales indígenas y no indígenas comprometidos con el Plan Alternativo de Salud y por ende con el bienestar de la población, especialmente en la salud reproductiva de la mujer.
Ver más 

 SOCIEDAD ARTISTICA, la más antigua agrupación social otavaleña se creó el 10 de agosto de 1909 con 26 socios, al año siguiente inició un plan  educativo con clases nocturnas, cursos especiales y conferencias.
Ver más 

 LIGA DEPORTIVA CANTONAL OTAVALO, la necesidad de contar con un organismo rector del deporte es  acuciante aproximadamente en 1942, iniciándose la denominada "Liga Deportiva", su primer presidente fue Don Rodrigo Pinto.
Ver más